Open/Close Menu ЦНИИ Туберкулеза

Ежегодная Всероссийская конференция молодых ученых с международным участием «Современные инновационные технологии в эпидемиологии, диагностике и лечении туберкулеза взрослых и детей». Конференция приурочена к Всемирному Дню борьбы с туберкулезом и посвящена 100-летию образования ЦНИИТ и предстоящему 300-летию со дня образования Российской академии наук 24-26 марта 2021 г., Москва — Санкт-Петербург

  • Программа

    «Современные инновационные технологии в эпидемиологии,

    диагностике и лечении туберкулеза взрослых и детей»,

    Москва – Санкт-Петербург,

    24‒26 марта 2021 года

    24 марта
    Трансляция конференции во все регионы РФ и страны СНГ

     

    Президиум:

    Эргешов А.Э., Яблонский П.К., Береговых В.В., Литвинов В.И.,

    Вуйнович М., Мордовин А.

    09:30 Атаджан Эргешович Эргешов,

    директор ФГБНУ «ЦНИИТ»,

    профессор

    Яблонский Петр Казимирович

    директор ФГБУ «СПб НИИФ» МЗ РФ, профессор

    Открытие конференции
    Представители:

    Министерства науки и высшего образования России,

    Российской академии наук,

    Министерства здравоохранения России,

    Всемирной организации здравоохранения,

    Международной Федерации обществ Красного Креста и Красного Полумесяца,

    Общественной организации «TBpeople»

    Приветствия участникам конференции молодых ученых
    Фундаментальные исследования во фтизиопульмонологии

    Сопредседатели: Еремеев В.В., Черноусова Л.Н., Лепеха Л.Н.,

    Виноградова Т.И., Журавлев В.Ю., Муравьев А.Н.

    10:30 Шепелькова Галина Сергеевна

    ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Сывороточные микро-РНК как биомаркер заболеваний легких различной этимологии
    10:40 Шорина Анастасия Владимировна

    ФГБОУ ВО «СПб ГПМУ» МЗ РФ,

    г. Санкт-Петербург, Россия

    Особенности совместного применения у детей тестов in vivo и in vitro, основанных на антигенах

    esat6-cfp10

    10:50 Богодухова Екатерина Сергеевна

    ФГБОУ ВО «ЧГМА» МЗ РФ,

    г. Чита, Россия

    Полиморфизм генов toll-like рецепторов как фактор предрасположенности к развитию различных форм туберкулеза органов дыхания
    11:00 Немкова Елизавета Кирилловна

    ФГБОУ «Новосибирский НИИТ»,

    г. Новосибирск, Россия

    Экстракорпоральная фотодинамическая терапия при туберкулезе: экспериментальное исследование
    11:10 Баранов Андрей Викторович

    ФГБУ «СЗОНКЦ

    им. Л.Г. Соколова» ФМБА России, г. Санкт-Петербург, Россия

    Применение электрического поля электрета в хирургическом лечении туберкулезного остита (экспериментальное исследование)
    11:20 Байкузина Полина Георгиевна

    ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Особенности действия вакцины БЦЖ у мышей линии B10.M (H2f)
    11:30 Султанов Санжар Аманович

    Ташкентская МА, г. Ташкент,

    Р. Узбекистан

    Нетуберкулезные микобактерии во фтизио-пульмонологической практике в Республике Узбекистан
    11:40 Кускова Дарья Сергеевна

    ФГБОУ «Новосибирский НИИТ»,

    г. Новосибирск, Россия

    Сравнение антимикобактериальных функций мезенхимальных стромальных клеток и макрофагов in vitro
    11:50 Масютин Александр Георгиевич

    ФГБОУ ВО «МГУ им М.В. Ломоносова» / ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Перспективы использования наночастиц алмаза для адресной доставки лекарств
    12:00 Оганесян Арман Артакович

    Центр Медицинской Генетики и Первичной Охраны Здоровья,

    г. Ереван, Армения

    Изменение ряда иммунологических маркеров в легких крыс при внутрибрюшинном введении липоарабиноманнана
    12:10 Адамовская Евгения Николаевна

    ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Определение роли различных биомаркеров в диагностике активности саркоидоза
    12:20 Гордеева Елизавета Игоревна

    ФГБОУ «Новосибирский НИИТ»,

    г. Новосибирск, Россия

    Анализ распространенности эндемичных клонов beijing М. tuberculosis у пациентов с туберкулезом легких в регионах Сибири и Дальнего Востока по результатам исследования операционного материала
    12:30 Павлова Екатерина Николаевна

    ФГБОУ ВО «МГУ им М.В. Ломоносова» / ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Нанорифампицин активирует фагоцитоз и снижает активность белка лекарственной устойчивости р-гликопротеина в макрофагах человека
    12:40 Осипов Татьана Васильевна

    Институт Фтизиопульмонологии «Кирилл Драганюк» г. Кишинев,

    Р. Молдова

    Особенности иммунологической реактивности и продукция оксида азота и его метаболитов у больных с туберкулезом легких и сочетанием COVID-19
    ПЕРЕРЫВ: 12:50–13:10
    Современные подходы к диагностике и лечению туберкулеза

    и других заболеваний органов дыхания (часть I)

    Сопредседатели: Комиссарова О.Г., Демихова О.В., Шмелев Е.И.,

    Павлова М.В., Суховская О.А., Гаврилов П.В.

    13:10 Мухаметшина Елена Радиевна

    ФГБУ «СПб НИИФ» МЗ РФ,

    г. Санкт-Петербург, Россия

    Частота встречаемости различных форм нейротуберкулеза у пациентов с ВИЧ-инфекцией
    13:20 Крушинская Екатерина Александровна

    ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Эффективность укороченных режимов химиотерапии у подростков, больных туберкулезом органов дыхания с МЛУ/ШЛУ МБТ
    13:30 Фаттахов Рафкат Акрамович

    Ташкентский ПМИ, г. Ташкент, Р. Узбекистан

    Прогностическая значимость факторов риска развития туберкулезного менингита
    13:40 Абу Аркуб Тамила Исмаиловна

    ГБУЗ «МНПЦ БТ ДЗМ»,

    г. Москва, Россия

    Саркоидоз легких при ВИЧ инфекции: миф или реальность?
    13.50 Стринович Анастасия Леонидовна

    ГУ «РНПЦ ПФ», г. Минск,

    Р. Беларусь

    Выявление туберкулезной инфицированности на основе применения теста, основанного на высвобождении гамма-интерферона
    14:00 Ахмедова Аминат Зейнудиновна

    ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Легочная реабилитация у больных с интерстициальными заболеваниями легких
    14:10 Анисимова Анастасия Ильинична

    ФГБУ «СПб НИИФ» МЗ РФ,

    г. Санкт-Петербург, Россия

    Что скрывается под кодом диагноза А16?
    14:20 Асанов Руслан Баймуратович

    ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Возможности дифференциальной диагностики деструктивного туберкулеза легких в условиях противотуберкулезного учреждения федерального уровня
    14:30 Дмитриев Кирилл Александрович

    ФГБУ «СПб НИИФ» МЗ РФ,

    г. Санкт-Петербург, Россия

    Характеристика микробного пейзажа нижних дыхательных путей у пациентов с пневмонией, вызванной COVID-19
    14:40 Чумоватов Никита Владимирович

    ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Распространенность курения табака среди пациентов с туберкулезом легких
    14:50 Прокопович Максим Александрович

    ГБУЗ «МНПЦ БТ ДЗМ»,

    г. Москва, Россия

    Патоморфоз туберкулеза в мегаполисе за последние 16 лет
    15:00 Хитева Антонина Юрьевна

    ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Коронавирусная инфекция у подростков, оперированных по поводу туберкулеза органов дыхания
    15:10 Саргсян Анна Петросовна

    ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Клинико-морфологические особенности нетуберкулезного микобактериоза у больных с хроническими заболеваниями легких
    25 марта
    Трансляция конференции во все регионы РФ и страны СНГ
    Современные подходы к диагностике и лечению туберкулеза

    и других заболеваний органов дыхания (часть II)

    Сопредседатели: Павлова М.В., Арчакова Л.И., Галкин Б.В.,

    Овсянкина Е.С., Абдуллаев Р.Ю., Романов В.В.

    09:30 Рахматулина Юлия Руслановна

    ФГБОУ ВО «СПб ГПМУ» МЗ РФ,

    г. Санкт-Петербург, Россия

    Анализ результатов стационарного этапа лечения туберкулеза у детей, выявленных в Санкт-Петербурге в 2019 году (когортное исследование)
    09:40 Седова Анастасия Павловна

    ФГБОУ ВО «ЯГМУ» МЗ РФ,

    г. Ярославль, Россия

    Особенности диагностики и лечения туберкулеза у больных старше 70 лет
    09:50 Пискунова Ольга Андреевна

    ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Бедаквилин в режимах химиотерапии туберкулеза органов дыхания с МЛУ/ШЛУ МБТ у подростков
    10:00 Грива Надежда Алексеевна

    ФГБУ «СПб НИИФ» МЗ РФ,

    г. Санкт-Петербург, Россия

    Количественная оценка эмфиземы легких с применением автоматических программ у пациентов с бронхоэктазами и инфекционными деструкциями легких
    10:10 Яковлева Елена Вадимовна

    ФГБОУ ВО «СамГМУ» МЗ РФ,

    г. Самара, Россия

    Современные особенности диссеминированного туберкулеза легких у пациентов с ВИЧ-инфекцией
    10:20 Торопова Виктория Алексеевна

    ФГБОУ ВО «СПб ГПМУ» МЗ РФ,

    г. Санкт-Петербург, Россия

    Лекарственно-индуцированные поражения печени у детей с различной патологией гепатобилиарной системы на фоне химиотерапии туберкулеза
    10:30 Передельская Марина Юрьевна

    ФГБОУ ДПО «РМАНПО» МЗ РФ,

    г. Москва, Россия

    Динамика популяционного риска развития хронического бронхита на фоне снижения распространенности употребления табака в Российской Федерации
    10:40 Лушина Олеся Викторовна

    ФГБУ «СПб НИИФ» МЗ РФ,

    г. Санкт-Петербург, Россия

    Ближайшие результаты лечения лекарственно-устойчивого туберкулеза легких у впервые выявленных пациентов
    10:50 Павлюшина Мария Сергеевна

    ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Течение новой коронавирусной инфекции у подростков с туберкулезом органов дыхания
    11:00 Шаламовский Вячеслав Владимирович

    ГУ «РНПЦ ПФ», г. Минск,

    Р. Беларусь

    Комплексная диагностика микобактериоза легких с применением молекулярно-

    генетических методов исследования материала, полученного при диагностической операции

    11:10 Смольникова Ульяна Алексеевна

    ФГБУ «СПб НИИФ» МЗ РФ,

    г. Санкт-Петербург, Россия

    Сравнительный анализ выявления округлых образований легких на рентгенограмме врачом и программой автоматического анализа изображений
    11:20 Трушин Егор Сергеевич

    ФГБОУ ВО «ЯГМУ» МЗ РФ,

    г. Ярославль, Россия

    Отдаленные результаты наблюдений больных туберкулезом, выявленных на поздней стадии ВИЧ-инфекции
    11:30 Чжао Ийменг

    ФГБУ «СПб НИИФ» МЗ РФ,

    г. Санкт-Петербург, Россия/

    Медицинская Школа Мичиганского университета, Энн-Арбор, Мичиган, США

    Распространение МЛУ ТБ среди пациентов с ВИЧ-инфекцией
    11:40 Полякова Анжела Сергеевна

    ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Эффективность лечения и частота побочных реакций у больных туберкулезом легких с множественной и широкой лекарственной устойчивостью микобактерий туберкулеза и структурно-функциональными изменениями щитовидной железы
    ПЕРЕРЫВ: 11:50–12:10
    Высокотехнологичные методы в диагностике и лечении туберкулеза

    Сопредседатели: Мушкин А.Ю., Васильев И.В., Загдын З.М.,

    Карпина Н.Л., Багиров М.А.

    12:10 Аубакиров Ержан Арыпканұлы

    ННЦФ РК МЗ РК, г. Алматы,

    Р. Казахстан

    Эффективность применения силиконового импланта и клапанной бронхоблокации при коллапсохирургическом лечении больных туберкулезом легких с широкой лекарственной устойчивостью
    12:20 Черкасов Артур Юрьевич

    ФГБУ «СПб НИИФ» МЗ РФ,

    г. Санкт-Петербург, Россия

    Эффективность хирургического лечения туберкулезного артрита с использованием цементных спейсеров
    12:30 Чесалина Яна Олеговна

    ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Сравнительная эффективность виртуальной бронхоскопии и радиальной эндосонографии в диагностике периферических образований легких – результаты рандомизированного исследования
    12:40 Денисова Нина Владимировна

    ФГБУ «СПб НИИФ» МЗ РФ,

    г. Санкт-Петербург, Россия

    Взаимосвязь послеоперационных осложнений с прогнозируемой функцией легких после пневмонэктомии у больных туберкулезом легких
    12:50 Тарасов Руслан Вячеславович

    ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Одномоментная интраоперационная коррекция медиастинальной легочной грыжи при трансстернальной окклюзии главного бронха у больных распространенным осложненным деструктивным туберкулезом легких
    13:00 Алиев Вилаят Камалович

    ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Предоперационная подготовка больных фиброзно-кавернозным туберкулезом легких с применением внутривенного лазерного облучения крови
    13:10 Читорелидзе Георгий Валерьевич

    ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Эффективность хирургического лечения больных распространенным деструктивным туберкулезом легких с сопутствующим сахарным диабетом с применением интраоперационной лазерной обработки слизистой главного бронха при пневмонэктомии
    13:20 Наумов Денис Георгиевич

    ФГБУ «СПб НИИФ» МЗ РФ,

    г. Санкт-Петербург, Россия

    Вентральная коррекция угловых кифозов у детей с инфекционными спондилитами
    13:30 Ткач Сергей Геннадьевич

    ФГБУ «СПб НИИФ» МЗ РФ,

    г. Санкт-Петербург, Россия

    Спондилиты шейного отдела позвоночника: тактические подходы и предикторы осложнений
    13:40 Каибов Герейхан Решадович

    ФГБУ «СПб НИИФ» МЗ РФ,

    г. Санкт-Петербург, Россия

    Осложнения в хирургии инфекционных спондилитов: причины и пути решения
    13:50 Совпенчук Игорь Алексеевич

    ФГБУ «СПб НИИФ» МЗ РФ,

    г. Санкт-Петербург, Россия

    Оценка качества жизни пациентов с инфекционными спондилитами: что влияет на удовлетворенность лечением?
    14:00 Аитова Яна Александровна

    ФГБУ «СПб НИИФ» МЗ РФ,

    г. Санкт-Петербург, Россия

    Годовой эпидемиологический мониторинг инфекций области хирургического вмешательства при хронических инфекционных поражениях скелета
    14:10 Обсуждение докладов. Выступления
    14:40 Итоги конкурса молодых ученых
    26 марта
    Трансляция конференции во все регионы РФ и страны СНГ

     

    Школа молодых ученых
    Президиум:

    Яблонский П.К., Соколович Е.Г., Сердобинцев М.С.

    09:30 Нечаева Ольга Брониславовна

    д.м.н., проф., ФГБУ «ЦНИИОИЗ» МЗ РФ,

    г. Москва, Россия

    Эпидемиологическая ситуация по туберкулезу в России
    10:10 Шовкун Людмила Анатольевна

    д.м.н., проф., гл. внештатный фтизиатр ЮФО

    Кампос Елена Диеговна

    к.м.н., ФГБОУ ВО «РостГМУ» МЗ РФ, г. Ростов-на-Дону, Россия

    Патогенетическая терапия больных туберкулезом в условиях пандемии COVID-19
    10:30 Морозова Татьяна Ивановна

    д.м.н., проф., ФГБОУ ВО «Саратовский ГМУ им. В.И. Разумовского» МЗ РФ, г. Саратов, Россия

    Возможности лечения больных туберкулезом комбинированными препаратами
    10:50 Шурыгин Александр Анатольевич

    доцент, д.м.н., ФГБОУ ВО «ПГМУ им. Академика Е.А. Вагнера» МЗ РФ, г. Пермь, Россия

    Рифапентин в практике врача-фтизиатра
    11:10 Яблонский Петр Казимирович

    д.м.н., проф., ФГБУ «СПб НИИФ» МЗ РФ, г. Санкт-Петербург, Россия

    Роль хирургии в комплексном лечении туберкулеза легких
    11:30 Слогоцкая Людмила Владимировна

    д.м.н., проф., ГБУЗ «МНПЦ БТ ДЗМ», г. Москва, Россия

    Современный взгляд на латентную туберкулезную инфекцию
    11:50 Мушкин Александр Юрьевич

    г.н.с., д.м.н., проф., ФГБУ «СПб НИИФ» МЗ РФ, г. Санкт-Петербург, Россия

    Деструктивные остеопатии у детей как междисциплинарная проблема
    12:10 Гаврилов Павел Владимирович

    в.н.с., к.м.н., ФГБУ «СПб НИИФ» МЗ РФ, г. Санкт-Петербург, Россия

    Искусственный интеллект как современный инструмент принятия решений в лучевой диагностике
    ПЕРЕРЫВ: 12:30–13:00
    Президиум:

    Эргешов А.Э., Еремеев В.В., Комиссарова О.Г.

    13:00 Овсянкина Елена Сергеевна, проф., ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия Новые решения и современные технологии в лечении туберкулеза у детей и подростков
    13:30 Андреевская Софья Николаевна

    с.н.с., к.м.н., ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Природа лекарственной устойчивости микобактерий туберкулеза
    14:00 Шабалина Ирина Юрьевна

    с.н.с., к.м.н., ФГБНУ «ЦНИИТ», г. Москва, Россия

    Навигационная бронхоскопия в диагностике туберкулеза органов дыхания – современные возможности и перспективы
    14:30 Еремеев Владимир Витальевич

    д.м.н., ФГБНУ «ЦНИИТ»,

    г. Москва, Россия

    Современные возможности конструирования вакцин
    15:00 Закрытие конференции
  • Требования к оформлению тезисов

    Уважаемые коллеги, обращаем Ваше внимание на то, что авторами и соавторами тезисов могут быть только ученые в возрасте до 40 лет. Научный руководитель работы (при наличии) будет указан в публикации отдельной строкой.

    Подача тезисов для опубликования не является заявкой на выступление с докладом.

    ОБЪЕМ тезисов – не более 4 печатных страниц формата А4, шрифт Times New Roman, кегль 12, межстрочный интервал 1,5, поля стандартные, выравнивание «по ширине», перенос слов – автоматический.

    СТРУКТУРА

    Строка 1: заголовок — прописные буквы жирным шрифтом

    Строка 2: фамилии и инициалы авторов жирным шрифтом

    Строка 3: полное название учреждения (без указания кафедры или отдела) с указанием города и страны — курсивом. Авторы, работающие в разных учреждениях, нумеруются цифрами (1, 2 и т.д.) после инициалов автора в соответствии с названием учреждения.

    Символы и сокращения при первом их использовании расшифровываются. В заголовке сокращения не допускаются. В тексте разрешается размещение одной таблицы. Сокращения, используемые при составлении таблиц, выносятся в примечание после таблицы. Рисунки, диаграммы и фотографии в тексте не допускаются.

    РАЗДЕЛЫ: цель исследования, материалы и методы, результаты, заключение (или выводы). Названия разделов выделяются жирным шрифтом.

     

    КОНТАКТНЫЕ ДАННЫЕ первого автора должны быть приложены отдельным файлом по форме (Приложение № 2).

    Название файла электронной версии тезисов формируется из ФИО первого автора, например, Иванов ИИ. Тезисы принимаются в электронном виде в формате Word (расширения .doc или .docx).

    ТРЕБОВАНИЯ К ФОТО: к тезисам должно быть приложено ЦВЕТНОЕ фото первого автора. Допускаются форматы: PNG, TIFF, JPEG. Фотографии в формате Word – не допускаются! Уважаемые авторы, при изготовлении фото помните, что оно будет размещено в печатном сборнике, и его увидит множество людей.

    Срок подачи тезисов – до 28 февраля 2021 г.

  • Образец

    РАЗРАБОТКА ТЕСТ-СИСТЕМЫ НА ОСНОВЕ ТЕХНОЛОГИИ ПЦР В РЕЖИМЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ ДЛЯ ВИДОВОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ НТМБ

     

    Устинова В.В.

     

    ФГБНУ «Центральный научно-исследовательский институт туберкулеза», г. Москва, Россия

     

    Цель исследования: во всем мире растет заболеваемость микобактериозом. Для развитых стран отмечают корреляцию сокращения числа случаев заболевания туберкулезом и увеличения заболеваемости микобактериозом. Клинические симптомы микобактериоза легких сходны с таковыми туберкулеза и хронических заболеваниях органов дыхания, а этиологический фактор микобактериоза, нетуберкулезные микобактерии (НТМБ), обладают устойчивостью к большинству противотуберкулезных препаратов (ПТП), поэтому важно вовремя дифференцировать их от микобактерий туберкулеза (МБТ). На сегодняшний день известно около 40 видов патогенных НТМБ, вызывающих микобактериоз. При этом для назначения адекватной химиотерапии врачу необходимо знать видовую принадлежность микобактерии, т.к. для разных видов характерен разный спектр устойчивости к лекарственным препаратам. В России зарегистрированы только два набора для видовой идентификации НТМБ производства немецкой компании Hain Lifescience, основанной на ПЦР с последующей гибридизацией продуктов реакции со специфическими зондами, иммобилизованными на нейлоновую мембрану. Эти тест-системы имеют ряд ограничений, главными из которых являются высокая стоимость исследования, длительное время проведения анализа и трудоемкость процесса постановки теста. В связи с этим целью нашего исследования стала разработка отечественной тест-системы для видовой идентификации НТМБ, распространенных на территории РФ. За основу разрабатываемой была принята технология ПЦР в режиме реального времени, позволяющая избежать недостатков существующих на отечественном рынке тест-систем.

    Материалы и методы

    Для выбора наиболее распространенных на территории РФ видов НТМБ была проанализирована видовая принадлежность штаммов НТМБ, полученных от больных с подозрением на туберкулез и микобактериоз, проходивших диагностику в ФГБНУ «ЦНИИТ» и лабораториях 17 региональных центров РФ. Штаммы были культивированы в автоматической системе учета роста культур Bactec MGIT 960.  Биоинформатический поиск участков геномов для видовой идентификации НТМБ проводили с использованием он-лайн версии ПО Artemis (//www.webact.org/WebACT/generate) и NCBI protein-protein blast. Выравнивание нуклеотидных последовательностей проводили по алгоритму Muscle в ПО Ugene UniPro. Видовая принадлежность штаммов НТМБ была определена с использованием тест-систем GenoTypeCM и GenoTypeAS (Hain Lifescience, Германия). Для оценки внутривидовой вариабельности выбранных областей геномов были отобраны штаммы для каждого вида НТМБ из коллекции отдела микробиологии ФГБНУ «ЦНИИТ», выделенных от разных больных в период с 2013-2017 г.: 25 штаммов M. avium, 22 — M. abscessus, 21 — M. chelonae, 15 — M. fortuitum, 20 – M. gordonae, 27 — M. intracellulare, 22 – M. kansasii, 25 – M. lentiflavum, 3 – M. mucogenicum, 4 – M.peregrinum, 2 – M. smegmatis, 15 – M. xenopi (всего 201 штамм НТМБ). Наработку ПЦР-фрагментов с использованием подобранных праймеров для дальнейшего секвенирования проводили в амплификаторе CFX96-Touch (Biorad, США) при следующих условиях: активация 95°С — 5 мин., далее 35 циклов: 95°С — 15 сек., 61°С — 30 сек., 72°С – 30 сек.; финальная элонгация 72°С – 15 мин. Очистку полученных ПЦР-продуктов проводили электрофорезом в 1% агарозном геле с использованием набора реагентов DNA purification kit (Omnix, Санкт-Петербург), либо ферментативно. Далее проводили циклическое секвенирование по Сэнгеру с набором ABI PRISM BigDye Terminator v.1.3 («Applied Biosystems», США), согласно инструкции производителя с последующим разделением продуктов реакции капиллярным гель-электрофорезом на генетическом анализаторе «Нанофор-05» («Синтол», Россия). Полученные в результате секвенирования последовательности были добавлены в выравнивания, выполненные на предыдущем этапе. Подбор праймеров и Taq-Man зондов для секвенирования и для видовой идентификации НТМБ проводили с помощью ПО Primer3.

     

    Результаты

    Результаты анализа наиболее часто встречающихся видов НТМБ на территории РФ представлены в таблице. По итогам анализа для разработки тест-системы были отобраны следующие виды: M. avium, M. abscessus, M. chelonae, M. fortuitum, M. gordonae, M. intracellulare, M. kansasii, M. lentiflavum, M. mucogenicum, M. peregrinum, M. smegmatis, M. xenopi, M. malmoense. Были выбраны участки геномов НТМБ для видовой идентификации, не использовавшиеся ранее, и выполнены их выравнивания. На основе выравниваний были подобраны праймеры для их прямого секвенирования. По результатам секвенирования была проведена оценка внутривидовой вариабельности выбранных участков геномов в клинических штаммах НТМБ и группировка видов для минимизации количества дифференцирующих смесей праймеров и зондов. Были разработаны системы видоспецифичных праймеров и зондов, учитывающие внутривидовую вариабельность НТМБ, выбранных для создания тест-системы. На сегодняшний день разработано 4 смеси, позволяющие выявлять каждая ДНК 3-х видов НТМБ и ДНК внутреннего положительного контроля. Первая смесь позволяет выявлять ДНК M. avium, M. intracellulare, M. xenopi; вторая – ДНК M. kansasii, M. gordonae, M. lentiflavum; третья – ДНК M. abscessus, M. chelonae, M. mucogenicum; четвертая – ДНК M. fortuitum, M. peregrinum и M. smegmatis.

    Таблица. Виды НТМБ, выделенные из культур от больных, использованных для анализа распространенности видов НТМБ на территории РФ

     

    Вид НТМБ Число больных Процент наиболее часто встречающихся видов НТМБ
    M. avium 223 27,6
    M. lentiflavum 127 15,4
    M. intracellulare 111 13,5
    M. gordonae 77 9,4
    M. fortuitum 76 9,2
    M. abscessus 62 7,5
    M. kansasii 53 6,4
    M. xenopi 39 4,7
    M. chelonae 18 2,2
    M. peregrinum 10 1,2
    M. malmoense 8 1
    M. smegmatis 4 0,5
    M. mucogenicum 3 0,4
    M. szulgai 2 0,2
    M. interjectum 2 0,2
    M. scrofulaceum 1 0,1
    M. simiae 1 0,1
    M. arupense 1 0,1
    M. kumamotenense 1 0,1
    Всего 822 100,0

    Для предварительной оценки специфичности разработанного прототипа тест-системы для видовой идентификации НТМБ были использованы 201 штамм НТМБ, 16 штаммов МБТК и 14 штаммов микроорганизмов, не относящихся к микобактериям, из коллекции отдела микробиологии ФГБНУ «ЦНИИТ». Была показана 100% специфичность реакционных смесей.

     

    Заключение

    Разработан прототип тест-системы для видовой идентификации НТМБ, наиболее распространенных на территории РФ. На данный момент тест-система проходит клинические испытания в отделе микробиологии ФГБНУ «ЦНИИТ».

    Устинова Вера Витальевна, младший научный сотрудник отдела микробиологии ФГБНУ «Центральный научно-исследовательский институт туберкулеза»

    107564, г. Москва, Яузская аллея, д. 2

    Тел.: +7 (ХХХ) ХХХ ХХХХ, e-mail: gmail@gmail.com

Поделиться:
CategoryНовости

2019 © - Создано и поддерживается в Musweb