Руководитель отдела микробиологии — д.б.н., профессор Черноусова Лариса Николаевна
В отделе микробиологии работают 2 доктора и 5 кандидатов наук, врачи-бактериологи, врачи клинической лабораторной диагностики.
С 2015 года отдел микробиологии сертифицирован Всемирной Организаций Здравоохранения как Центр передового опыта Сети супра-национальных референс-лабораторий ВОЗ


Сотрудники отдела микробиологии активно работают в научно-исследовательских проектах, поддержанных Министерством Здравоохранения Российской Федерации, Министерством промышленности, Министерством образования и науки России, Фондом гражданских исследований и развития (CRDF), Международным научно-техническим центром (МНТЦ), Российским Фондом Фундаментальных Исследований (РФФИ).
Являются членами Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов им. И.И.Мечникова, (Московское отделение, секция микробиологии и иммунологии туберкулеза), Ассоциации фтизиатров России, European Respiratory Society (ERS), International Union Against Tuberculosis and Lung Disease (IUATLD).

Основные направления деятельности отдела микробиологии:

  • Фундаментальные исследования: направлены на изучение биологических свойств M.tuberculosis, их вирулентности, особенностей выживания в эукариотических клетках, взаимодействия патоген-хозяин в зависимости от кластерной принадлежности M.tuberculosis, изучение механизмов развития лекарственной устойчивости и путей распространения и передачи как M.tuberculosis различных генетических кластеров, так и нетуберкулезных микобактерий.
Изучение роли различных видов микроорганизмов в патогенезе заболеваний органов дыхания (стафилококков, стрептококков, нейссерий, бактерий рода Haemophilus, коринеформных бактерий, энтеробактерий, неферментирующих грамотрицательных бактерий, в частности атипичных и беспегментных псевдомонад, а также различных видов рода Pseudomonas, сходных по морфологическим и биохимическим свойствам с Р.aeruginosa.
  • Прикладные исследования: направлены на автоматизацию процедур молекулярно-генетической и микробиологической диагностики туберкулеза, апробацию и внедрение инновационных диагностических тест-систем, оценка их значимости для практической фтизиатрии, разработки новых подходов к видовой идентификации туберкулезных и нетуберкулезных микобактерий, испытания противотуберкулезной активности новых синтетических и природных соединений в отношении лабораторных и клинических штаммов M.tuberculosis в экспериментах in vitro и ex vivo.
    Совершенствование методологических приемов выделения, идентификации, определения свойств бактериальных штаммов и их резистентности к антибиотикам, серологическое типирование культур пневмококков иммунными сыворотками, ацидометрический метод определения β- лактомаз, метод определения адгезивной способности бактерий.
  • Клинические исследования направлены на обнаружение туберкулезных и нетуберкулезных микобактерий и определение их лекарственной чувствительности; бактериологическую диагностику заболеваний органов дыхания нетуберкулезной этиологии, а также сопутствующей патологии у больных туберкулезом.
  • Организационно-методическая работа представлена участием в курации региональных специализированных бактериологических лабораторий с целью совершенствования качества микробиологических исследований и инфекционного контроля в противотуберкулезных учреждениях, разработкой нормативных документов, руководств и научно-методических рекомендаций, преподавательской и экспертной деятельностью.

Отдел микробиологии включает 3 лаборатории:

Лаборатория микробиологической диагностики туберкулеза

зав. — к.б.н. Ларионова Елена Евгеньевна

larinova2

Выполняет следующие исследования:

  • Бактериоскопия диагностического материала на наличие кислотоустойчивых бактерий
  • Посев диагностического материала на плотной питательной среде и жидкой питательной среде в автоматической системе ВАСТЕС MGIT
  • Определение лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза к ПТП 1-го и 2-го ряда в автоматической системе ВАСТЕС MGIT
  • Определение лекарственной чувствительности МБТ к пиразинамиду PZA в автоматической системе ВАСТЕС MGIT
  • Определение лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза к линезолиду, ПАСК, моксифлоксацину на жидкой питательной среде в автоматической системе ВАСТЕС MGIT
  • Выявление и определение лекарственной чувствительности нетуберкулезных микобактерий

Лаборатория молекулярно-генетических методов исследования

зав. лабораторией — проф. Черноусова Лариса Николаевна

В лаборатории выполняются следующие виды исследований:

  • Выявление ДНК МБТ методом ПЦР в режиме реального времени из диагностического материала
  • Определение чувствительности МБТ к рифампицину (RIF), изониазиду (INH) и фторхинолонам (FQ) методом ПЦР в режиме реального времени из диагностического материала
  • Выявление ДНК МБТ и определение ЛЧ к рифампицину (RIF) в картридже GeneXpert MTB\RIF
  • Определение чувствительности к рифампицину (RIF), изониазиду (INH) и фторхинолонам (FQ), аминогликозидам\циклическим пептидам (AG\CP) и этамбутолу (EMB) на ДНК-стрипах из диагностического материала
  • Идентификация культур на род Mycobacterium методом ПЦР
  • Определение вида туберкулезных и нетуберкулезных микобактерий на ДНК-стрипах

Лаборатория неспецифической микрофлоры

зав. лабораторией — кандидат медицинских наук. Пузанов Владимир Алексеевич
puzanov vladimir

Окончил I Московский медицинский институт им. И.М. Сеченова в 1981 г., специализация – врач-эпидемиолог.
Работает в ФГБНУ «ЦНИИТ» с 1985г. в отделе микробиологии, в лаборатории микробиологической диагностики туберкулеза. Сотрудник центра передового опыта Сети супра-национальных референс-лабораторий ВОЗ. Член Ассоциации фтизиатров России; European Respiratory Society (ERS); International Union Against Tuberculosis and Lung Disease (IUATLD), тематических рабочих групп РГВУ по Лабораторной диагностике туберкулеза и Инфекционному контролю; эксперт ФСВОК.
Основные направления работы: культуральная диагностика, разработка оптимальных принципов организации работы лабораторной сети для диагностики туберкулеза в условиях ПМСП в гражданском и пенитенциарном секторе; курация проектов по выявлению и лечению больных ТВ, преподавательская деятельность на курсах обучения по стратегии ВОЗ для врачей-лаборантов ПМСП и бактериологов специализированных ПТУ в гражданском и пенитенциарном секторе, разработка и реализация стандартов внешнего и внутреннего контроля качества бактериологических исследований, экспертная деятельность.
Соавтор более 170-ти научных публикаций и 6-ти руководств, 2-х патентов и рацпредложений. Научный консультант 3-х диссертаций на соискание ученой степени канд. мед. наук.
Эл. почта: hot.pznv@gmail.com

В лаборатории выполняются следующие виды исследований:

  • Микробиологическую диагностику облигатно-аэробных, факультативно-анаэробных, микроанаэрофильных микроорганизмов для ранней диагностики гнойно-воспалительных осложнений и выбора оптимальной лечебной тактики.
  • Исследование нарушений состояния нормальной микрофлоры кишечника при туберкулезе и других заболеваниях органов дыхания, разработка методов их коррекции (бактериологическое исследование содержимого толстого кишечника на дисбактериоз).
  • Лаборатория выполняет весь объем исследований у больных стационара и пациентов консультативно-поликлинического отделения института.
  • Исследуются следующие виды патологического материала:
    • мокрота, промывные воды бронхов, пунктаты инфильтратов или абсцесса легких, бронхиальные смывы, аспираты, плевральные экссудаты, отделяемое лимфоузлов, свищей, открытые инфицированные раны, спинномозговая жидкость;
    • мазки из зева, миндалин, носовой полости (на носительство Staphylococcus aureus и при подозрении на Klebsiella sрpecies, а так же при различных инфекциях носа и глотки;
    • отделяемое глаз (коньюктива, край век, роговица), ушей, при заболеваниях полости рта, языка, зубов, кусочки органов и тканей, кровь и гной при аутопсии;
    • кровь при подозрении на бактериемию и сепсис (ускоренный метод), количественное исследование бактерий в моче (выявление бактериурии), исследование содержимого толстого кишечника на дисбактериоз.
  • Применение новейших методов бактериологической диагностики (в частности «Микра-ла-тестов», индикаторных бактериологических систем, а также ручной и автоматизированной идентификационной системы BBL Crystal) позволяет идентифицировать до 500 видов различных микроорганизмов. Санитарно-бактериологический раздел представлен исследованиями воздуха в центральном стерилизационном отделении, в отделе эндоскопии, смывов с предметов окружающей среды и обстановки, рук и одежды персонала, а также в проверке качества стерильных растворов, приготовленных в аптеке института.

Сотрудники отдела микробиологии

Севастьянова Элина Викторовна

Доктор биологических наук, ведущий научный сотрудникelina viktorovna

Окончила в 1986 году с отличием Московский ордена Трудового Красного Знамени технологический институт пищевой промышленности по специальности «Технология микробиологических и витаминных производств».
С 1994 года работает в отделе микробиологии ЦНИИТ. Проходила обучение по программам, поддержанным ВОЗ, CDC, МФОКК, Eagleson Institute, FILHA, IUATLD.
Сотрудник центра передового опыта Сети супра-национальных референс-лабораторий ВОЗ, преподаватель обучающих курсов ЦНИИТ, куратор региональных лабораторий по диагностике туберкулеза, секретарь Тематической рабочей группы «Лабораторная диагностика туберкулеза» при Рабочей группе высокого уровня по туберкулезу в РФ при МЗ РФ и ВОЗ, член экспертной группы при ФСВОК по специальности микробиологическая диагностика туберкулеза, член Европейской лабораторной инициативы по туберкулезу при Европейском бюро ВОЗ, секретарь секции Микробиологии и иммунологии туберкулеза Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов им. И.И.Мечникова (московское отделение).
Основные направления работы: разработка оптимальных принципов организации работы лабораторной сети для диагностики туберкулеза; анализ деятельности лабораторий и совершенствование системы обеспечения качества микробиологических исследований; инфекционный контроль в противотуберкулезных учреждениях и обеспечение биологической безопасности в специализированных бактериологических лабораториях; разработка нормативных документов, руководств и научно-методических рекомендаций; преподавательская и экспертная деятельность.
Автор более 100 печатных работ, в том числе – 6 Учебных пособий, 4 Федеральных клинических рекомендаций, 3 Руководства, 1 Методические рекомендации для врачей, 1 Методическое пособие для врачей.

Автор более 100 печатных работ, в том числе – 6 Учебных пособий, 4 Федеральных клинических рекомендаций, 3 Руководства, 1 Методические рекомендации для врачей, 1 Методическое пособие для врачей.

Смирнова Татьяна Геннадьевна

Кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник

Окончила Российский государственный медицинский Университет в 1998 г. медико-биологический факультет, кафедра биохимии, специализация – молекулярная биология.
Основные и смежные специальности: врач-биохимик, микробиология, врач клинической лабораторной диагностики.
Работает в ФГБНУ «ЦНИИТ» в отделе микробиологии, в лаборатории молекулярно-генетических методов исследований с 1998 года. Сотрудник центра передового опыта Сети супра-национальных референс-лабораторий ВОЗ. Преподаватель обучающих курсов ЦНИИТ по вопросам микробиологической и молекулярно-генетической диагностики туберкулеза и микобактериальных инфекций, специалист по обучению работе на автоматизированной системе BACTEC MGIT 960, эксперт по лабораторной диагностике фтизиатрического профиля, один из разработчиков нормативных документов.
Область научных и клинических интересов: специалист в области микробиологической и молекулярно-генетической диагностики туберкулеза и определения лекарственной чувствительности микобактерий, генотипирование штаммов M.tuberculosis complex (сполиготипирование, RFLP IS6110), совершенствование диагностики инфекций, вызванных нетуберкулезными микобактериями, масс-спектрометрический анализ белковых профилей микобактерий туберкулезного комплекса, нетуберкулезных микобактерий и неспецифической флоры, разработка методов определения противотуберкулезной активности вновь синтезированных субстанций in vitro и ex vivo.
Автор более 75 статей в зарубежных и отечественных журналах, в том числе 1-го учебного пособия и 3-х методических рекомендаций.
Эл. почта:  t.smirnova@ctri.ru

Старший научный сотрудник, кандидат медицинских наук

Андреевская Софья Николаевна
Основная и смежные специальности: врач-биохимик, микробиология, врач клинической лабораторной диагностики.
Окончила медико-биологический факультет, кафедру биохимии Российского государственного медицинского Университета в 1998 г., специализация – молекулярная биология.
Работает в ФГБНУ «ЦНИИТ» в отделе микробиологии, в лаборатории молекулярно-генетических методов исследования с 1998 г. Сотрудник центра передового опыта Сети супра-национальных референс-лабораторий ВОЗ.
Область научных интересов: молекулярная эпидемиология, генотипирование штаммов M.tuberculosis, внутривидовое разнообразие M.tuberculosis, биологические свойства штаммов микобактерий в зависимости от кластерной принадлежности, распространенность генетических кластеров M.tuberculosis, трансмиссивность и вирулентность микобактерий туберкулеза, взаимодействие патоген–хозяин, модельные исследования остро прогрессирующего туберкулеза, мета-анализ данных по генотипированию и лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза, определение противотуберкулезной активности химических соединений in vitro и ex vivo, микробиологическая и молекулярно-генетическая диагностика туберкулеза и микобактериозов.
Автор более 57 статей в отечественных и зарубежных журналах, в том числе 1 учебного пособия и 3 методических рекомендаций.
Эл. почта: s.andreevskaya@ctri.ru

Поделиться: