Руководитель отдела микробиологии — доктор биологических наук, профессор Черноусова Лариса Николаевна

В отделе микробиологии работают 2 доктора и 4 кандидата наук, врачи-бактериологи, врачи клинической лабораторной диагностики.

Черноусова Лариса Николаевна окончила биологический факультет Московского государственного университета им. М. В. Ломоносова. Специальность по образованию, квалификация: биология, иммунология-аллергология, бактериология.

В ФГБНУ «ЦНИИТ» работает с 1986 года. С 1998 года — доктор биологических наук, с 2007 года имеет звание профессора, с 2008 года — руководитель отдела микробиологии.
Л.Н. Черноусова является одним из ведущих специалистов ЦНИИТ в области фундаментальных исследований. Область научных интересов включает экспериментальные исследования туберкулезной инфекции, иммунный ответ при различных формах туберкулеза, аспекты патогенеза туберкулеза (микробиологические и молекулярно-генетические характеристики развития экспериментального туберкулеза, лекарственная устойчивость микобактерий, тестируемая как микробиологическими методами, так и определением точечных мутаций в геноме, генотипирование МБТ с использованием RFLP, сполиготипирования, VNTR-типирования). Научные интересы также связаны с изучением механизмов развития лекарственной устойчивости M.tuberculosis, исследованием наиболее распространенных в РФ штаммов микобактерий туберкулеза Beijing кластера и изучением их повышенной трансмиссивности.

Основная научная тематика направлена на молекулярно-эпидемиологические исследования во фтизиатрии, разработку ускоренных методов выявления и определения лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза и создание современного алгоритма микробиологической диагностики туберкулеза и микобактериозов. Важным разделом научной деятельности является разработка подходов к изучению эффективности химиотерапии и тестированию новых противотуберкулезных соединений, выявление наиболее активных из них в отношении МЛУ и ШЛУ штаммов.

Под руководством Л.Н. Черноусовой защищены 11 кандидатских и 2 докторских диссертации.
Является руководителем Центра передового опыта Сети супра-национальных референс-лабораторий ВОЗ, членом Тематической рабочей группы по лабораторной диагностике туберкулеза при РГВУ по туберкулезу МЗ РФ и ВОЗ, членом экспертной группы по лабораторной диагностике туберкулеза при ФСВОК РФ, членом Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов им. И.И. Мечникова; членом Ассоциации фтизиатров России (РОФ) и Национальной ассоциации фтизиатров (НАФ). Член Ученого совета ЦНИИТ и редколлегии журналов «Бактериология» и «Вестник ЦНИИТ».
Читает лекции и проводит семинары для аспирантов и ординаторов ФГБНУ «ЦНИИТ» и врачей-лаборантов из территорий РФ и стран СНГ.
Автор более 100-а печатных работ, в том числе 2-х монографий и 2-х глав в руководстве, 2-х глав в книге, 5-ти методических рекомендаций федерального уровня. Автор 5-ти патентов.

С 2015 года отдел микробиологии сертифицирован Всемирной Организаций Здравоохранения как Центр передового опыта Сети супра-национальных референс-лабораторий ВОЗ.


Сотрудники отдела микробиологии активно работают в научно-исследовательских проектах, поддержанных Министерством Здравоохранения Российской Федерации, Министерством промышленности, Министерством образования и науки России, Фондом гражданских исследований и развития (CRDF), Международным научно-техническим центром (МНТЦ), Российским Фондом Фундаментальных Исследований (РФФИ).
Являются членами Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов им. И.И.Мечникова, (Московское отделение, секция микробиологии и иммунологии туберкулеза), Ассоциации фтизиатров России, European Respiratory Society (ERS), International Union Against Tuberculosis and Lung Disease (IUATLD).

Основные направления деятельности отдела микробиологии:

  • Фундаментальные исследования направлены на изучение биологических свойств M.tuberculosis, их вирулентности, особенностей выживания в эукариотических клетках, взаимодействия патоген-хозяин в зависимости от кластерной принадлежности M.tuberculosis, изучение механизмов развития лекарственной устойчивости и путей распространения и передачи как M.tuberculosis различных генетических кластеров, так и нетуберкулезных микобактерий.
 Изучение роли различных видов микроорганизмов в патогенезе заболеваний органов дыхания (стафилококков, стрептококков, нейссерий, бактерий рода Haemophilus, коринеформных бактерий, энтеробактерий, неферментирующих грамотрицательных бактерий, в частности атипичных и беспегментных псевдомонад, а также различных видов рода Pseudomonas, сходных по морфологическим и биохимическим свойствам с Р.aeruginosa.
  • Прикладные исследования направлены на автоматизацию процедур молекулярно-генетической и микробиологической диагностики туберкулеза, апробацию и внедрение инновационных диагностических тест-систем, оценка их значимости для практической фтизиатрии, разработки новых подходов к видовой идентификации туберкулезных и нетуберкулезных микобактерий, испытания противотуберкулезной активности новых синтетических и природных соединений в отношении лабораторных и клинических штаммов M.tuberculosis в экспериментах in vitro и ex vivo.
    Совершенствование методологических приемов выделения, идентификации, определения свойств бактериальных штаммов и их резистентности к антибиотикам, серологическое типирование культур пневмококков иммунными сыворотками, ацидометрический метод определения β- лактомаз, метод определения адгезивной способности бактерий.
  • Клинические исследования направлены на обнаружение туберкулезных и нетуберкулезных микобактерий и определение их лекарственной чувствительности; бактериологическую диагностику заболеваний органов дыхания нетуберкулезной этиологии, а также сопутствующей патологии у больных туберкулезом.
  • Организационно-методическая работа представлена участием в курации региональных специализированных бактериологических лабораторий с целью совершенствования качества микробиологических исследований и инфекционного контроля в противотуберкулезных учреждениях, разработкой нормативных документов, руководств и научно-методических рекомендаций, преподавательской и экспертной деятельностью.
  • Сотрудничество с международными организациями.
  • Деятельность в качестве национального Центра передового опыта сети супранациональных ТБ референс-лабораторий ВОЗ.

Отдел микробиологии включает 3 лаборатории:

Лаборатория микробиологической диагностики туберкулеза

Заведующая  лабораториейкандидат биологических наук, старший научный сотрудник Ларионова Елена Евгеньевна

larinova2

Ларионова Елена Евгеньевна — с 1995 года работает в Центральном научно-исследовательском институте туберкулеза. Кандидат биологических наук, старший научный сотрудник отдела микробиологии. Заведующая лабораторией микробиологической диагностики туберкулеза. Сотрудник центра передового опыта Сети супра-национальных референс-лабораторий ВОЗ. Преподаватель обучающего центра ВОЗ по борьбе с туберкулезом в Российской Федерации. Сертифицирована на проведение исследований по стандартам надлежащей клинической практики. Имеет удостоверение о повышении квалификации — основы биобанкирования: теория и практика.
Основные направления работы: культуральная и молекулярно-генетическая диагностика туберкулеза и микобактериоза, разработка оптимальных принципов организации работы лабораторий для диагностики туберкулеза, преподавательская деятельность, разработка и реализация стандартов внешнего и внутреннего контроля качества бактериологических и молекулярно-генетических исследований. Соавтор более 110-ти публикаций в отечественных и зарубежных журналах, 6-и федеральных клинических рекомендаций. Автор 1-го патента.

Лаборатория выполняет следующие исследования:

  • Бактериоскопия диагностического материала на наличие кислотоустойчивых бактерий
  • Посев диагностического материала на плотной питательной среде и жидкой питательной среде в автоматической системе ВАСТЕС MGIT
  • Определение лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза к ПТП 1-го и 2-го ряда в автоматической системе ВАСТЕС MGIT
  • Определение лекарственной чувствительности МБТ к пиразинамиду PZA в автоматической системе ВАСТЕС MGIT
  • Определение лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза к линезолиду, ПАСК, моксифлоксацину на жидкой питательной среде в автоматической системе ВАСТЕС MGIT
  • Выявление и определение лекарственной чувствительности нетуберкулезных микобактерий

Лаборатория молекулярно-генетических методов исследования

Заведующая лабораториейдоктор биологических наук, профессор Черноусова Лариса Николаевна

В лаборатории выполняются следующие виды исследований:

  • Выявление ДНК МБТ методом ПЦР в режиме реального времени из диагностического материала
  • Определение чувствительности МБТ к рифампицину (RIF), изониазиду (INH) и фторхинолонам (FQ) методом ПЦР в режиме реального времени из диагностического материала
  • Выявление ДНК МБТ и определение ЛЧ к рифампицину (RIF) в картридже GeneXpert MTB\RIF
  • Определение чувствительности к рифампицину (RIF), изониазиду (INH) и фторхинолонам (FQ), аминогликозидам\циклическим пептидам (AG\CP) и этамбутолу (EMB) на ДНК-стрипах из диагностического материала
  • Идентификация культур на род Mycobacterium методом ПЦР
  • Определение вида туберкулезных и нетуберкулезных микобактерий на ДНК-стрипах

Лаборатория неспецифической микрофлоры

Заведующий лабораторией — кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник Пузанов Владимир Алексеевич
puzanov vladimir

Основная и смежные специальности: микробиология, врач-бактериолог (высшая квалификационная категория).
Окончил I Московский медицинский институт им. И.М. Сеченова в 1981 году, специализация – врач-эпидемиолог.
 Работает в ФГБНУ «ЦНИИТ» с 1985 года в отделе микробиологии, в лаборатории неспецифической микрофлоры.

Основные направления работы:
до 2017 года – микробиологическая диагностика туберкулеза;
в настоящее время — клиническая микробиологическая диагностика облигатно-аэробных, факультативно-анаэробных, микроанаэрофильных микроорганизмов для ранней диагностики гнойно-воспалительных осложнений и выбора оптимальной тактики лечения. Исследование нарушений состояния нормальной микрофлоры кишечника (дисбактериоз) при туберкулезе и других заболеваниях органов дыхания, разработка методов их коррекции.
Эксперт экспертной группы Ведомственной аттестационной комиссии ФАНО по получению квалификационных категорий медицинских и фармацевтических работников.
Член Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов им. И.И. Мечникова; Ассоциации фтизиатров России (РОФ); European Respiratory Society (ERS); International Union Against Tuberculosis and Lung Disease (IUATLD), тематических рабочих групп РГВУ по Лабораторной диагностике туберкулеза и Инфекционному контролю; эксперт ФСВОК. 
Соавтор более 180-ти научных публикаций и 6-ти руководств, 2-х патентов и рацпредложений. Научный консультант 3-х диссертаций на соискание ученой степени кандидата медицинских наук.
Эл. почта: hot.pznv@gmail.com

В лаборатории выполняются следующие виды исследований:

  • Микробиологическая диагностика облигатно-аэробных, факультативно-анаэробных, микроанаэрофильных микроорганизмов для ранней диагностики гнойно-воспалительных осложнений и выбора оптимальной лечебной тактики
  • Исследование нарушений состояния нормальной микрофлоры кишечника (дисбактериоз) при туберкулезе и других заболеваниях органов дыхания, разработка методов их коррекции;
  • Лаборатория выполняет широкий спектр клинических микробиологических исследований различных диагностических материалов от больных клиник института и амбулаторных пациентов консультативно-поликлинического отделения института. Применение классических и современных методов бактериологической диагностики (в том числе автоматизированных анализаторов) позволяет идентифицировать до 500 видов различных микроорганизмов
    • Исследуются следующие виды диагностических патологического и физиологического материала:
      • мокрота, промывные воды бронхов, пунктаты инфильтратов или абсцесса легких, постоперационные ткани, бронхиальные смывы, аспираты, плевральные экссудаты, отделяемое лимфоузлов, свищей, открытые инфицированные раны, спинномозговая жидкость
      • мазки из зева, миндалин, носовой полости (на носительство Staphylococcus aureus и при подозрении на Klebsiella sрp.), а также при различных инфекционных заболеваниях носа и глотки
      • отделяемое глаз, ушей, при заболеваниях полости рта, языка, зубов, кусочки органов и тканей, кровь и гной при аутопсии
      • кровь при подозрении на бактериемию и сепсис (ускоренный метод)
      • выделение и идентификация бактерий в моче
  • Определение лекарственной чувствительности выделенных микроорганизмов к антибактериальным препаратам
  • Лаборатория выполняет регламентированные приказами МЗ санитарно-бактериологические исследования воздуха и смывов во всех подразделениях института
  • Лаборатория проводит самостоятельные научные исследования, а также корпоративные научные исследования в рамках выполнения плана НИР, как в институте, так и совместные научно-практические исследования с другими организациями, в т.ч. на договорной основе

Сотрудники отдела микробиологии:

Севастьянова Элина Викторовна

Доктор биологических наук, ведущий научный сотрудникelina viktorovna

С отличием окончила Московский ордена Трудового Красного Знамени технологический институт пищевой промышленности по специальности «Технология микробиологических и витаминных производств».
С 1994 года работает в отделе микробиологии ЦНИИТ. Неоднократно повышала свою квалификацию на курсах обучения, организованных ВОЗ, CDC, МФОКК, Eagleson Institute, FILHA, IUATLD. Активно участвовала в многочисленных проектах по борьбе с туберкулезом, осуществлявшихся в РФ при поддержке международных организаций.
В настоящее время — сотрудник Центра передового опыта Сети супранациональных ТБ референс-лабораторий ВОЗ, преподаватель обучающих курсов на базе Учебного центра ЦНИИТ, куратор региональных лабораторий по диагностике туберкулеза, секретарь Тематической рабочей группы «Лабораторная диагностика туберкулеза» при Рабочей группе высокого уровня по туберкулезу в РФ при МЗ РФ и ВОЗ, член Европейской лабораторной инициативы по туберкулезу при Европейском бюро ВОЗ, член экспертной группы ФСВОК по специальности микробиологическая диагностика туберкулеза, секретарь секции Микробиологии и иммунологии туберкулеза Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов им. И.И. Мечникова (московское отделение), член Ассоциации фтизиатров России (РОФ).
Основные направления работы: разработка оптимальных принципов организации работы лабораторной сети для диагностики туберкулеза; анализ деятельности лабораторий и совершенствование системы обеспечения качества микробиологических исследований; инфекционный контроль в противотуберкулезных учреждениях и обеспечение биологической безопасности в специализированных бактериологических лабораториях; разработка нормативных документов, руководств и научно-методических рекомендаций; преподавательская и экспертная деятельность.
 Автор более 100-а печатных работ, в том числе 6-ти  учебных пособий, 4-х федеральных клинических рекомендаций, 5-ти  руководств, 1-й методической рекомендации для врачей и 1-го методического пособия для врачей.

Смирнова Татьяна Геннадьевна

Кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник

Окончила Российский государственный медицинский Университет в 1998 году медико-биологический факультет, кафедра биохимии, специализация – молекулярная биология.
 Основные и смежные специальности: врач-биохимик, микробиология, врач клинической лабораторной диагностики.
 Работает в ФГБНУ «ЦНИИТ» в отделе микробиологии, в лаборатории молекулярно-генетических методов исследований с 1998 года. Сотрудник центра передового опыта Сети супра-национальных референс-лабораторий ВОЗ. Преподаватель обучающих курсов ЦНИИТ по вопросам микробиологической и молекулярно-генетической диагностики туберкулеза и микобактериальных инфекций, специалист по обучению работе на автоматизированной системе BACTEC MGIT 960, эксперт по лабораторной диагностике фтизиатрического профиля, один из разработчиков нормативных документов.
Область научных и клинических интересов: специалист в области микробиологической и молекулярно-генетической диагностики туберкулеза и определения лекарственной чувствительности микобактерий, генотипирование штаммов M.tuberculosis complex (сполиготипирование, RFLP IS6110), совершенствование диагностики инфекций, вызванных нетуберкулезными микобактериями, масс-спектрометрический анализ белковых профилей микобактерий туберкулезного комплекса, нетуберкулезных микобактерий и неспецифической флоры, разработка методов определения противотуберкулезной активности вновь синтезированных субстанций in vitro и ex vivo.
Эл. почта:  t.smirnova@ctri.ru

Автор более 75-и статей в зарубежных и отечественных журналах, в том числе 1-го учебного пособия, 4-х методических рекомендаций и 3-х глав в руководстве для врачей. Автор 2-х патентов. Имеет сертификат GCP.

Андреевская Софья Николаевна

Кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник

Основная и смежные специальности: врач-биохимик, микробиология, врач клинической лабораторной диагностики. Окончила медико-биологический факультет, кафедру биохимии Российского государственного медицинского Университета в 1998 году, специализация – молекулярная биология. Работает в ФГБНУ «ЦНИИТ» в отделе микробиологии, в лаборатории молекулярно-генетических методов исследования с 1998 г. Сотрудник центра передового опыта Сети супра-национальных референс-лабораторий ВОЗ. Область научных интересов: молекулярная эпидемиология, генотипирование штаммов M.tuberculosis, внутривидовое разнообразие M.tuberculosis, биологические свойства штаммов микобактерий в зависимости от кластерной принадлежности, трансмиссивность и вирулентность микобактерий туберкулеза, взаимодействие патоген–хозяин, модельные исследования остро прогрессирующего и хронического туберкулеза, определение противотуберкулезной активности химических соединений in vitro и ex vivo, микробиологическая и молекулярно-генетическая диагностика туберкулеза и микобактериозов. Автор более 60-ти статей в отечественных и зарубежных журналах, в том числе 1-го учебного пособия и 3-х методических рекомендаций. Автор 2-х патентов. Имеет сертификат GCP.
Эл. почта: s.andreevskaya@ctri.ru

Поделиться: